デフォルトでは /var/mail なんてディレクトリを見に行ってしまう．
fetchmail (というより procmail) は普通に /var/spool/mail に書きに行くので，
ソース (Makefile) を修正．
diff -ur usr.org/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile usr/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile

--- usr.org/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile	2001-07-06 15:08:18.000000000 +0900

+++ usr/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile	2002-06-19 20:34:30.000000000 +0900

@@ -221,7 +221,7 @@

 cyg:	# Cygwin 1.0

 	$(BUILD) `$(CAT) SPECIALS` OS=$@ \

 	SIGTYPE=psx CRXTYPE=nfs \

-	SPOOLDIR=/var CC=gcc \

+	SPOOLDIR=/var/spool CC=gcc \

 	ACTIVEFILE=/usr/local/news/lib/active \

 	RSHPATH=/usr/bin/rsh \

 	BASECFLAGS="-O -DCYGWIN" \

diff -ur usr.org/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile.add usr/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile.add

--- usr.org/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile.add	2001-01-31 13:27:26.000000000 +0900

+++ usr/local/src/imap-2000/imap-2000a/src/osdep/unix/Makefile.add	2002-06-19 20:34:40.000000000 +0900

@@ -1,7 +1,7 @@

 cyg:	# Cygwin 1.0

 	$(BUILD) `$(CAT) SPECIALS` OS=$@ \

 	SIGTYPE=psx CRXTYPE=nfs \

-	SPOOLDIR=/var CC=gcc \

+	SPOOLDIR=/var/spool CC=gcc \

 	ACTIVEFILE=/usr/local/news/lib/active \

 	RSHPATH=/usr/bin/rsh \

 	BASECFLAGS="-O" \
あと，このPCではウィルスバスターの POP スキャンで
pop3 のポート 110 が占領されてるので，別ポートで立ち上げるために
設定ファイル /etc/c-client.cf を記述．
また，/cygdrive/c/WINNT/system32/drivers/services に対応するポート名を
適当に追加して，/etc/inetd.conf もそのポート名に変更．
I accept the risk for IMAP toolkit 4.1.

set pop3-port (ポート番号)